王朝更迭和一場洪災，令神童尚灝與青梅竹馬的小夥伴丁牧雲家破人亡，從此天隔一方。八年後，瑨朝國君為中興國家，祭起“文治天下，科技興邦”的大旗，在沙海深處創建以廣博天下能人異士，培育青年英才為目的的“尚方書院”。 各路天才少年與紈絝子弟紛迭而來。身負血海深仇的特工尚灝與叫花子丁牧雲在書院重聚，與隱姓埋名的皇子結成同盟。少年們在研習各種技能之際，為了各自的陣營與目標鬥智鬥勇，逐漸完成了從少年到成人的蛻變。

1938年，前晉綏軍逃兵晏軻，在死刑前夜成功越獄，隨後潛入太原日料店伺機為班長報仇。不久後，他在日料店意外救下刺殺日軍司令未遂的軍統精英楊嘯，並被其帶入軍統機關做..