誰知冇有溫馨幾天，長沙城又發作一場更大的動亂。
《曾國藩年譜》：鹹豐三年，"正月，公在長沙督辦街團，委在籍江蘇候補知州黃廷瓚、安徽候補知縣曹光漢編查保甲"。"時公於長沙城中魚塘口為行轅，設審案局，委候補知州劉建德、照磨嚴良峻承審，拿獲強盜，立予嚴訊，用巡撫令旗即行正法，或即斃之杖下。彆離會匪、教匪、盜匪及平常痞匪項目，按情罪以處辦。公意純用重法以鋤刁悍，而殘暴嚴格之名在所不辭也"。
曾國藩唆使審案局，對這些風險社會治安的不良分子，一概處以重刑。為著鼓勵團丁，他規定，凡捉一強盜，賞銀五兩。重賞之下，團丁個個主動，有的一天乃至捉幾個送來。不管是遊匪、匪賊、搶王、盜賊及其他肇事者，捉一個，殺一個。不管誰來講情，曾國藩都不寬宥。他常對委員們講，彈壓匪亂，要心狠手辣，不講仁慈，要以申、韓、商鞅的手腕辦案，不要怕此後得車裂的了局。為著收到殺一儆百的結果，曾國藩命人製作十個木籠，取名叫站籠。站籠約一人高，犯人頭卡在木枷中，四肢捆綁，站在籠子裡。白日用車拉著，在城內四周遊街。夜晚則放在露天裡，派兵守住。不給吃，也不給喝，不出三四天，犯人便慘死在籠子裡。這十個站籠每天都裝著犯人，每天都在長沙城內巡遊，弄得全城百姓見之發怵，無人不知審案局的幫辦團練大臣曾國藩殘暴酷毒。士民鄉紳要求拔除站籠實施仁政的狀子，雪片似的飛往巡撫簽押房，有幾個心腸軟的委員們也到張亮基那兒告狀，並以辭職相威脅。張亮基對此一概不睬，反而獎飾曾國藩有膽有識，剛烈精乾。曾國藩看到團練有效果，匪亂報警日漸減少，感到統統都很順利，心中甚為對勁。
武漢三鎮失守，使鹹豐帝大為大怒。署湖廣總督徐廣縉被撤職嚴辦，張亮基奉調到武昌，代替徐廣縉的空缺。張亮基視江忠源為擺佈手，他把江忠源及其一千楚勇也帶到武昌，剩下的五百楚勇編為一營，由江忠源的表兄鄒壽璋、弟弟江忠濟統帶，作為大團的第三營，接管曾國藩的批示。這時，郭嵩燾也分開長沙回湘陰捐獻。接著羅繞典受命到江西當巡撫，潘鐸因病告免，嶽興阿遷升湖北佈政使。駱秉章又回到湖南來當巡撫，他請朝廷調老僚屬徐有壬從雲南到長沙來當佈政使，又向朝廷保舉衡永郴桂道陶恩培升任按察使。一時候，湖南初級官員改換一新。在曾國藩看來，駱秉章庸碌、徐有壬淺顯、陶恩培無能，他從內心瞧不起。曾國藩曉得此後會有掣肘，但他不顧這些，仍然像張亮基在長沙時那樣我行我素地乾下去。