十一月，元軍顛末修整後，在九州本地征收足了行軍用的糧草，又從高麗來的船隊彌補了彈藥，統統籌辦結束，於二旬日乘船解纜，打擊四國島。
此光陰甲士數固然大大超越元軍，但是如何批示這些平時互不統屬的軍人們協同作戰，成了擺在鎌倉幕府麵前的一道困難。而元軍冇有給幕府處理困難的時候。
元軍進入大阪後，忻都兌現了信譽，對城內住民秋毫無犯，征集糧秣物質也都“儘給其值”，被稱為“佛兵”。不甘心投降的一些日本軍人對元軍建議他殺式的進犯，多數被殺，大阪城守草井友長及其部下三十二人敗北後退入梵刹內，切腹他殺。
北條時宗所率日本軍人軍隊約五萬人，馬隊約有五千，其他皆為步兵，此次打擊一改之前的“一騎討”作戰體例，而是象元軍一樣的策動了個人衝鋒。元軍還是先施放火炮轟擊日軍，繼以弩箭，然後以馬隊策動打擊。日軍在元軍狠惡的炮火轟擊下死傷累累，衝近的日本軍人也多數給弩箭射成了刺蝟，日本軍人固然有精美的刀具，但除了一些將擁有好的鎧甲防護外，大多數下級軍人隻要粗陋的鎧甲，因此死傷慘痛，五萬雄師在元軍的進犯下很快崩潰，北條時宗在戰役中也被元軍炮火擊傷，“鐵片洞其鎧甲，肩臂皆穿”，鮮血將他的鎧甲染紅，元軍馬隊瞥見其衣甲光鮮，知其為大將，簇擁而來，欲擒獲之，千鈞一髮之際，一名叫竹崎季長的軍人策馬趕到，將北條時宗拖出了交兵地區，方纔免於其被元軍擒捉的了局。
北條時宗率殘兵退入京都，據城戍守。在擊潰日軍以後，元軍並冇有急於攻城，而是追擊崩潰的日本軍人，將其儘數斬殺，一時候京都城下屍如山積，登城瞭望敵情的北條時宗見狀，驚怒交集，口噴鮮血，暈厥疇昔，後為天皇派來的太醫救醒。
為了防備元軍來襲，在幕府的嚴令下，日本軍人們在本地一帶構築了大量稱為“元寇防壘”的石壘，並保衛於壘後。元兵艦隊達到四國的宇和海岸後，發明瞭這一環境，先集合戰船上的火炮向石壘轟擊，因為元軍炮火凶悍，石壘多被擊破，保衛石壘的日本軍人死傷慘痛，看到元軍登岸，日本軍人軍隊向元軍建議了衝鋒，但很快便倒在元軍射出的麋集箭雨之下。顛末兩天的戰役，日本人苦心構築的“元寇防壘”被元軍衝破，守軍多數被毀滅，獨一少數人幸運逃脫。
在打擊宇和的同時，另一支元兵艦隊駛入土佐灣，元軍登岸後霸占高知城，然後與從宇和前來的元軍會師，掃蕩日軍，七今後，元軍勝利占據四國島全境。