方從哲又上奏要歸老，這不曉得是朱由校即位以來的第幾次了。之前每次朱由校都是慰留，現在能夠真的抗不住上麵的進犯了。詳細來講，進犯他的主如果三個方麵，一是舉薦、犒賞李可灼。二是未加以防備，導致先皇駕崩。三是與鄭家勾搭。朱由校不想方從哲走，如果他走了，全部朝堂就真的變成了東林人的一言堂了，即便是做擋箭牌，也不能讓他走。因而下旨：首輔所為，朕曆曆在目，舉薦李可灼，正為首輔職責，犒賞乃先皇之意，其他未加防備及與鄭家勾搭，均為莫須有之事。言官論事，不成傳聞，須有實據。著方從哲封為太師，進中極殿大學士。
十仲春二十四，大學士方從哲等以遼陽垂危，乞借發帑金。朱由校下旨:朕心念遼軍缺餉，準將大婚典禮所用銀兩暫借百萬給發。戶部尚書李汝華奏，因為遼餉過量，使得外庫已經冇有多少銀兩了，不得已才乞助內庫。這讓朱由校更加心急造幣機的題目了，要徐光啟催問布羽士，布羽士說現在從大明到西地契程就要一年多，以是造幣機的題目隻能等才行。