顛末rì軍海陸軍數rì圍攻，6月3rì，防衛周到的基隆要塞隨即淪陷，rì軍轉而向台北北部的獅球嶺打擊。
5月13rì上午，rì本zhèng fǔ從東京致電美國駐běi jīng公使田貝並轉給清zhèng fǔ，要求派員去台灣辦理交割手續。其電文以下：“rì本朝廷業已派海軍提督子爵樺山資紀作為台灣、澎湖等島巡撫，並授以欽差大臣之職，準其遵循馬關所立條約之第五款末節辦理統統事件。該撫約於兩禮拜以內到差。抵任時，即行辦理特委事件。rì本zhèng fǔ即希中國zhèng fǔ立派欽差大臣一員或數員停止交割。
唐景崧倒也不加坦白，將本身的擔憂和已作的籌辦對丘逢甲和盤托出，在邵友濂還在任時已經奏請朝廷調遣福建海軍提督楊岐珍並三營人馬赴台北，統領基隆各軍，以老將南澳鎮總兵劉永福率所部入台賣力台南防務，同時調總兵廖得勝、副將佘致廷率部赴台，賣力台北守備。
4月19rì，朝廷覆電台灣巡撫唐景崧，正式奉告他割台一事，並給他解釋了割台的苦處：“台灣雖重，比之京師則台為輕。倘仇敵乘勝直攻大沽，則京師危在朝夕。台灣弧懸外洋，終久不能扼守。……不成因一時義憤，遂忘之前所陳各種患害於不顧也”
21rì，台北商民鳴鑼罷市，擁入巡撫衙門，哭聲震天。唐景崧電奏光緒皇上，要求保住台灣。他在電報中說：“祖宗締造之艱，史冊俱在，傳至二百餘年，失自皇上之手，天下後代，謂皇上為何君?他rì更何故見祖宗於地下？臣為祖宗守土，唯有與台為存亡，不敢奉皇上之詔。”
但是，李鴻章不但代奏無效，還吃到一番怒斥。光緒帝下諭旨說道：“李鴻章身膺重擔，當將此事妥籌結局，豈得置身事外?現倭使將次到台，仍著李經方敏捷前去，毋得畏難退避。倘因拖延貽誤，唯李經方是問!李鴻章也不能辭其咎!欽此。”
在佈政使任上乾了三年多的唐景崧在他的教員張之洞的死力保薦下，終究坐到了台灣巡撫的寶座上，不過此時必裡倒是憂愁多於高興。
丘逢甲跟著賴鶴年進到內堂，見到唐景崧後深施一禮：“晚生末學丘逢甲見過撫台大人！”
林朝棟聞聽台北垂危，當即率棟軍五營前去聲援。
隨即rì軍即超出三貂嶺，直撲基隆側後。
大總統：唐景崧，軍務大臣：李秉瑞，外務大臣：俞明震，外務大臣：陳季同，義兵總兵：李惟義，團練批示使：丘逢甲，遊說使：姚文棟，議長：林維源，台中鎮守使：林朝棟，台南鎮守使：劉永福。